Un virus aux gènes inconnus de la science découvert au Brésil

Un virus aux gènes inconnus de la science découvert au Brésil
Un virus aux gènes inconnus de la science découvert au Brésil
Anonim

Des scientifiques ont découvert un nouveau virus au Brésil, dont l'ADN est composé à 90 % de gènes inconnus de la science. Les résultats de la découverte sont publiés sur le site de préimpression bioRxiv.

Le virus a été détecté dans le lac artificiel de Pampulha dans la ville brésilienne de Belo Horizonte. Son génome peu complexe est presque entièrement constitué de gènes inconnus de la science. Les auteurs ont nommé le nouveau virus Yaravirus brasiliensis d'après la nymphe aquatique Yara de la mythologie des peuples d'Amérique du Sud.

Les scientifiques spéculent qu'ils sont confrontés au premier cas d'un groupe isolé de virus inconnu ou d'une espèce éloignée d'un virus géant qui a évolué vers une forme plus petite.

Découverts seulement au 21e siècle, les virus géants atteignent des tailles comparables à celles d'une cellule bactérienne. Ils tirent leur nom de leurs énormes capsides - des membranes protéiques qui encapsulent des virions - des particules virales. Ils ont également un ADN de la longueur appropriée, qui dépasse 200 000 paires de bases et contient souvent les gènes dits orphelins ou orphelins (ORFan), qui ne se trouvent dans aucun autre groupe d'organismes.

Les génomes complexes permettent aux virus géants de synthétiser des protéines et donc d'effectuer la réparation, la réplication, la transcription et la traduction de l'ADN. Avant leur découverte, on croyait que les virus n'avaient pas de telles capacités, car ce sont des créatures inertes qui ne peuvent infecter que leurs hôtes. Tous les virus géants connus sont des parasites des amibes.

Et bien que la taille du nouveau micro-organisme soit nettement inférieure à celle des virus géants - environ 80 nanomètres - il parasite également les amibes, et son génome est presque totalement orphelin: 68 de ses gènes (plus de 90 %) ne trouvent pas d'analogues dans tout organisme connu, et seulement six vaguement similaires à ceux connus de la science.

"C'est parce que le virus est une nouvelle lignée de virus amibiens avec des origines et une phylogénie étonnantes", a déclaré l'un des responsables de l'étude, Jônatas Abrahão de l'Université fédérale de Minas Gerais au Brésil, dans un communiqué de presse.

Les scientifiques ont analysé plus de huit mille et demi de métagénomes, mais n'ont pas trouvé parmi eux de virus liés au nouveau micro-organisme. Comme les autres virus de ce groupe, il est représenté par un ADN double brin, dont la longueur est de 44 900 paires de bases et contient 74 fragments codants.

« En utilisant des protocoles standard, notre toute première analyse génétique n'a pu détecter aucune séquence de capside reconnaissable ou d'autres gènes viraux classiques dans le yaravirus », explique Yonatas Abrajao et le deuxième responsable de l'étude Bernard La Scola de l'Université d'Aix-Marseille en France.

Selon les protocoles métagénomiques officiels, le yaravirus ne peut même pas être reconnu comme un agent viral, car il n'a aucune similitude claire avec eux. Les scientifiques ne peuvent pas encore dire ce qu'il est vraiment - un représentant d'un groupe complètement nouveau ou un descendant d'un virus géant qui a évolué d'une manière ou d'une autre vers une forme plus petite.

"Le nombre de protéines inconnues qui composent les particules du yaravirus reflète la variabilité qui existe dans le monde viral et le nombre de nouveaux génomes viraux qui restent à découvrir", concluent les auteurs.

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